Para utilizar Server-Side Include no servidor, extensões .shtml e .shtm, é necessário habilitar o recurso no servidor, é possível fazer isso pelo PowerShell, para isso abra o PowerShell, em 64bits se o seu sistema for 64bits, e digite os seguintes comandos:
Import-Module ServerManager Add-WindowsFeature Web-Includes |
Após isso é necessário reboot do servidor, após reinicializar o SSI estará habilitado no IIS.