Nas versões mais recentes do IIS é possível atribuir processadores específicos para uma pool de aplicativo, alterando o valor do atributo Processor Affinity Mask. Para definir quais processadores a pool de aplicativo irá utilizar, podemos seguir a tabela abaixo:
Se quiser utilizar as CPUs 0 e 2, então some os valores do último campo, informe o valor 5, se quiser utilizar as CPUs 1, 2 e 3, informe o valor 14.
Mais detalhes explicando no link abaixo:
http://serverfault.com/questions/471105/formula-for-processor-affinity-mask-iis